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J-GLOBAL ID：202102265041735749   整理番号：21A1283161

次世代シークエンシングを用いたハウスダストの包括的真菌コミュニティ分析【JST・京大機械翻訳】

Comprehensive Fungal Community Analysis of House Dust Using Next-Generation Sequencing

著者 (13件)： Izawa Kazuki (Department of Computer Science, School of Computing, Tokyo Institute of Technology, Meguro-ku, Tokyo 152-8550, Japan) ,  Kubosaki Atsutaka (Division of Microbiology, National Institute of Health Sciences, Kawasaki-ku, Kawasaki, Kanagawa 210-9501, Japan) ,  Kobayashi Naoki (Department of Food and Life Science, School of Life and Environmental Science, Azabu University, Chuo-ku, Sagamihara, Kanagawa 252-5201, Japan) ,  Akiyama Yutaka (Department of Computer Science, School of Computing, Tokyo Institute of Technology, Meguro-ku, Tokyo 152-8550, Japan) ,  Yamazaki Akiko (Department of Veterinary Medicine, Faculty of Agriculture, Iwate University, Morioka, Iwate 020-8550, Japan) ,  Hashimoto Kazuhiro (Laboratory of Integrated Pest Management, FCG Research Institute, Inc., Koto-ku, Tokyo 135-0064, Japan) ,  Konuma Rumi (Tokyo Metropolitan Industrial Technology Research Institute, Koto-ku, Tokyo 135-0064, Japan) ,  Kamata Yoichi (Department of Food Design, Faculty of Nutritional Science, Koshien University, Takarazuka, Hyogo 665-0006, Japan) ,  Kamata Yoichi (Department of Food and Nutrition, Faculty of Human Life Science, Senri Kinran University, Suita, Osaka 565-0873, Japan) ,  Hara-Kudo Yukiko (Division of Microbiology, National Institute of Health Sciences, Kawasaki-ku, Kawasaki, Kanagawa 210-9501, Japan) ,  Hasegawa Kenichi (Department of Architecture and Environment Systems, Faculty of Systems Science and Technology, Akita Prefectural University, Yurihonjo, Akita 015-0055, Japan) ,  Ikaga Toshiharu (Department of System Design Engineering, Faculty of Science and Technology, Keio University, Kohoku-ku, Yokohama, Kanagawa 223-8522, Japan) ,  Watanabe Maiko (Division of Microbiology, National Institute of Health Sciences, Kawasaki-ku, Kawasaki, Kanagawa 210-9501, Japan)
資料名： International Journal of Environmental Research and Public Health (Web)  (International Journal of Environmental Research and Public Health (Web))
巻： 17  号： 16  ページ： 5842  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7208A  ISSN： 1660-4601  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 家庭における真菌群集分析は,菌類が現在アレルゲンと考えられているため,注目を集めている。現在,これらの分析は培養法を用いて行われるが,家庭の真菌群集は培養が困難な種を含むことが多い。対照的に,次世代シークエンシング(NGS)は,種同定を容易にする包括的,労働的および時間節約的アプローチを代表する。しかしながら,NGS法の信頼性は,培養法のそれと比較された。本研究では,この応用の信頼性を実証する試みにおいて,真菌ゲノムにおける内部転写スペーサー1(ITS1)を標的にするNGS法を用いて,18のハウスダストサンプルについて真菌群集分析を行い,菌類群集構造を分析した。NGS法は,Aspergillus,Penicillium,Cladosporiumおよび酵母の相対存在量に関する培養法と正相関し,家屋で発見された主要な真菌成分であった。さらに,Malasseziaのようないくつかの属は,敏感に検出できた。結果は,NGS法の信頼性が培養法のそれに匹敵し,容易に利用可能なデータベースが,属レベルで十分に分類されていない登録の除去を含む修正を必要とすることを示す。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 信頼性 ,  データベース ,  コミュニティ ,  アレルゲン ,  酵母 ,  順相 ,  *ハウスダスト ,  真菌ゲノム ,  ITS領域 ,  *次世代シークエンシング ,  *菌類 ,  アオカビ属 ,  コウジカビ属 ,  クラドスポリウム属 ,  マラセチア属 ,  *微生物 ,  *汚染物質 ,  *大気汚染物質 ,  *物質 ,  不完全菌類 ,  不完全糸状菌類 ,  不整子嚢菌類
準シソーラス用語： *真菌類 ,  Penicillium ,  Aspergillus ,  Cladosporium ,  Malassezia , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： ハウスダスト ,  菌類群集分析 ,  ITS領域 ,  次世代シークエンシング

分類 (1件)： 微生物の生態  (EG03040J)

引用文献 (21件)：

• Johansson, E.; Reponen, T.; Meller, J.; Vesper, S.; Yadav, J. Association of Streptomyces community composition determined by PCR-denaturing gradient gel electrophoresis with indoor mold status. Environ. Monit. Assess. 2014, 186, 8773-8783.
• Day, D.B.; Basavanna, U. Real-time PCR detection of Listeria monocytogenes in infant formula and lettuce following macrophage-based isolation and enrichment. J. Appl. Microbiol. 2015, 118, 233-244.
• The Human Microbiome Project Consortium. Structure, function and diversity of the healthy human microbiome. Nature 2012, 486, 207-214.
• Louca, S.; Mazel, F.; Doebeli, M.; Parfrey, L.W. A census-based estimate of Earth’s bacterial and archaeal diversity. PLoS ONE 2019, 17, e3000106.
• Baxi, S.N.; Portnoy, J.M.; Larenas-Linnemann, D.; Phipatanakul, W.; Barnes, C.; Grimes, C.; Horner, W.E.; Kennedy, K.; Levetin, E.; Miller, J.D.; et al. Exposure and Health Effects of Fungi on Humans. J. Allergy Clin. Immunol. Pract. 2016, 4, 396-404.

タイトルに関連する用語 (5件)： 次世代シークエンシング ,  ハウスダスト ,  真菌 ,  コミュニティ ,  分析