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J-GLOBAL ID：202302290283300318   整理番号：23A2724624

東洋ヨトウ,Mythimna separata(鱗翅目:ヤガ科)の参照ゲノム配列【JST・京大機械翻訳】

Reference Genome Sequences of the Oriental Armyworm, Mythimna separata (Lepidoptera: Noctuidae)

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著者 (6件)： Yokoi Kakeru (Insect Design Technology Group, Division of Insect Advanced Technology, Institute of Agrobiological Sciences, National Agriculture and Food Research Organization (NARO), 1-2 Owashi, Tsukuba 305-0901, Japan) ,  Furukawa Seiichi (Institute of Life and Environmental Sciences, University of Tsukuba, Tsukuba 305-8572, Japan) ,  Zhou Rui (Degree Program in Agro-Bioresources Science and Technology, University of Tsukuba, Tsukuba 305-8572, Japan) ,  Jouraku Akiya (Insect Design Technology Group, Division of Insect Advanced Technology, Institute of Agrobiological Sciences, National Agriculture and Food Research Organization (NARO), 1-2 Owashi, Tsukuba 305-0901, Japan) ,  Bono Hidemasa (Laboratory of Genome Informatics, Graduate School of Integrated Sciences for Life, Hiroshima University, 3-10-23 Kagamiyama, Higashi-Hiroshima City 739-0046, Japan) ,  Bono Hidemasa (Laboratory of BioDX, Genome Editing Innovation Center, Hiroshima University, 3-10-23 Kagamiyama, Higashi-Hiroshima City 739-0046, Japan)
資料名： Insects (Web)  (Insects (Web))
巻： 13  号： 12  ページ： 1172  発行年： 2022年 
JST資料番号： U7206A  ISSN： 2075-4450  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 鱗翅類昆虫は,昆虫および絹産業における生化学および生理学的モデル種および主要な農業害虫であるその他を含む動物の重要なグループである。したがって,いくつかの鱗翅類昆虫のゲノム配列が報告されている。東洋虫,Mythimna separataは,昆虫の免疫反応と寄生バチとの相互作用を宿主として研究するために一般的に使用される農業害虫である。これらの研究トピックの理解を改善するために,参照ゲノム配列を本研究で構築した。長読および短読取配列データを用いて,de novo集合および研磨を行い,ハプロティグをパージした。その後,遺伝子予測と機能的アノテーションを実施した。Tollおよび免疫欠損(IMD)経路およびC型レクチンのオーソログを探索するため,注釈データ解析,BLASTpおよびHummerスキャンを行った。M.separataゲノムは682Mbp;コンティグN50は2.7Mbpで,21,970の遺伝子と24,452のコード部位を予測した。TollとIMD経路のコア成分のすべてのオルソログと105のC型レクチンを同定した。これらの結果は,ゲノムデータが参照ゲノムデータとして使用するための十分な品質であり,分子およびゲノムレベルでのM.separataおよび鱗翅類研究の促進に寄与することを示唆する。Copyright 2023 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  害虫 ,  遺伝子 ,  宿主 ,  *ヌクレオチド配列 ,  絹 ,  *ゲノム ,  *アワヨトウ ,  クローン ,  寄生バチ ,  アノテーション ,  オルソログ ,  *ゲノム配列 ,  コンティグ ,  免疫応答 ,  昆虫綱 ,  *ガ ,  *無脊椎動物 ,  節足動物
準シソーラス用語： 免疫反応 ,  昆虫類 ,  *Mythimna , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ゲノム配列 ,  Mythimna separata ,  Toll経路 ,  IMD経路 ,  C型レクチン

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  蚕  (FD04020M)

引用文献 (64件)：

• Goergen, G.; Kumar, P.L.; Sankung, S.B.; Togola, A.; Tamò, M. First Report of Outbreaks of the Fall Armyworm Spodoptera frugiperda (J E Smith) (Lepidoptera, Noctuidae), a New Alien Invasive Pest in West and Central Africa. PLoS ONE 2016, 11, e0165632.
• Cheng, T.; Wu, J.; Wu, Y.; Chilukuri, R.V.; Huang, L.; Yamamoto, K.; Feng, L.; Li, W.; Chen, Z.; Guo, H.; et al. Genomic Adaptation to Polyphagy and Insecticides in a Major East Asian Noctuid Pest. Nat. Ecol. Evol. 2017, 1, 1747-1756.
• Sharma, H.C.; Davies, J.C. The Oriental Armyworm, Mythimna separata (Wlk.). Distribution, Biology and Control: A Literature Review. Orient. Armyworm Myth. Sep. Wlk Distrib. Biol. Control Lit. Rev. 1983, 59, 1-24.
• Hiruma, K.; Riddiford, L.M. Developmental Expression of MRNAs for Epidermal and Fat Body Proteins and Hormonally Regulated Transcription Factors in the Tobacco Hornworm, Manduca sexta. J. Insect Physiol. 2010, 56, 1390-1395.
• Kanost, M.R.; Jiang, H.; Yu, X.-Q. Innate Immune Responses of a Lepidopteran Insect, Manduca sexta. Immunol. Rev. 2004, 198, 97-105.

タイトルに関連する用語 (3件)： 鱗翅目 ,  ヤガ科 ,  参照ゲノム